工藤新一是全 国著名的高中生侦探，在一次追查黑衣人犯罪团伙时不幸被团伙成员发现，击晕后喂了神奇的药水，工藤新一变回了小孩！新一找到了经常帮助他的阿笠博 士，博士为他度身打造不少间谍武器。为了防止 犯罪团伙对他进行报复，新一决定隐姓埋名，暗中追 查他们，希望能得 到解药。一日，新 一 的女友毛利兰来到了 阿笠博士的家寻找 男友 的下落，被小 兰撞见的新一情急之 下 编造了自己名叫江户川柯南， 随后 柯南寄居在了小兰家 。 小兰的父亲毛利小五郎是一 名私家 侦探， 新一可 以籍着和他 一起四 出办案一起追查黑夜人 的下落。柯南在小学认识步美等小学生，他们一起 组织了一个少年侦探团，向罪犯宣战！
